آموزش شبیه سازی دینامیک مولکولی با نرم افزار لمپس LAMMPS
4 ساعت
3.8
استفاده از شبیه سازی رایانه ای در کنار پژوهش های تجربی به دلیل محدودیت های آزمایشگاهی در مقیاس نانو کمک قابل توجهی به فهم پدیده های فیزیکی می کند. یکی از کارآمدترین روش های شبیه سازی رایانه ای برای مطالعه ساختار، عملکرد و خواص مواد و یا حتی طراحی ساختار جدید با ویژگی های مورد نظر در مقیاس مولکولی، استفاده از دینامیک مولکولی است. پکیج (Package) های نرم افزاری مختلفی برای انجام شبیه سازی دینامیک مولکولی وجود دارد که از جمله آن ها می توان به: LAMMPS, Materials Studio, GROMACS و Amber اشاره کرد. لمپس (LAMMPS) یک بسته نرم افزاری دینامیک مولکولی است که برای شبیه سازی سیستم هایی با فاز مایع، جامد و گاز به کار می رود. این نرم افزار یک نرم افزار متن باز (Open source) است که دارای قابلیت اجرای موازی را دارد و از آن می توان برای مدل سازی اتمی، پلیمری، بیولوژیکی، فلزی، گرانول، و سیستم های دانه درشت استفاده کرد، همچنین دارای انواع پتانسیل های برهمکنش ذرات است. این فرادرس شامل شبیه سازی دینامیک مولکولی و کار با بسته نرم افزاری لمپس است و در این فرادرس با نحوه نصب لمپس روی ویندوز و لینوکس، دستورات لمپس و نحوه اجرای کدها آشنا خواهید شد، همچنین نرم افزارهای جانبی مانند: متریال استودیو (Materials Studio)، پک مول و وی ام دی (VMD) که در کار با لمپس به ما کمک می کند نیز آموزش داده خواهد شد.
