آموزش مصورسازی و تحلیل داده های علوم زیستی در R Studio + مثال عملی
3 ساعت
4.9
نرمافزار R چیست؟ نرمافزار R، ابزار بسیار مهم برای تحلیل دادههای آماری است. یکی از کاربردهای مهم این نرمافزار تحلیل دادههای بزرگ زیستی از جمله دادههای بیان ژنی است. با کمک این نرمافزار محاسباتی، میتوان به آسانی دادههای بیان ژنی را در محیط نرمافزار فراخوانی کرد، سپس آنالیزهای مورد نیاز را انجام داد و در ادامه، نتایج حاصل از تحلیل دادهها را در این نرمافزار و در قالب نمودارهای متنوع، نمایش داد. اهمیت یادگیری مصورسازی و تحلیل دادههای علوم زیستی در R Studio چیست؟ با کشف روش Real-Time PCR، محققین حوزه زیستشناسی توانستند میزان بیان تعداد محدودی ژن را در نمونههای سلولی یا بافتی مورد ارزیابی قرار دهند؛ اما با پیشرفت دانش بشری، ابزارها و روشهای جدید مانند توالییابی نسل جدید (Next-generation sequencing (NGS)) و ریزآرایهها (Microarray) جهت اندازهگیری بیان ژنی به صورت موازی، برای هزاران ژن به وجود آمده است. دیتاها و نتایج انبوهی که از این روشها حاصل شدند، در پایگاههای داده ژنومی مانند Genomic Data Commons Data Portal (GDC Data Portal) برای نمونههای گوناگون بیماریها ذخیره میشوند. بنابراین ابزارهای محاسباتی جهت آنالیز این دادههای حجیم مورد نیاز است و نرمافزار R، با امکانات بسیار خوبی که دارد، میتواند در فراخوانی دادهها، تجزیهوتحلیل آنها و مصورسازی نتایج به صورت کاملا قابل فهم عمل کند. این نرمافزار کاملا رایگان است و امکانات آن در قالب پکیجهای متنوع در دسترس عموم قرار دارد. در این فرادرس چه چیزی یاد میگیریم؟ در این آموزش، ابتدا دادههای حجیم (Big Data) در حوزه زیستشناسی را بررسی میکنیم، سپس با پایگاه داده GDC Data Portal آشنا میشویم. در ادامه، به سراغ نرمافزار R میرویم و کتابخانههای مرتبط با آن را مورد بررسی قرار میدهیم و در نهایت، با ذکر یک مثال عملی، آنالیز دادههای RNA-Seq را انجام خواهیم داد.
